AT5G21482.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.989 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cytokinin oxidase 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
This gene used to be called AtCKX5. It encodes a protein whose sequence is similar to cytokinin oxidase/dehydrogenase, which catalyzes the degradation of cytokinins. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
cytokinin oxidase 7 (CKX7); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cytokinin dehydrogenase 1, FAD/cytokinin binding domain (InterPro:IPR015345), FAD-binding, type 2 (InterPro:IPR016166), FAD-linked oxidase-like, C-terminal (InterPro:IPR016164), FAD linked oxidase, N-terminal (InterPro:IPR006094); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cytokinin oxidase/dehydrogenase 1 (TAIR:AT2G41510.1); Has 8328 Blast hits to 8321 proteins in 1506 species: Archae - 208; Bacteria - 5322; Metazoa - 141; Fungi - 1495; Plants - 573; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 589 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:7226842..7230052 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 57978.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.78 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 524 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MIAYIEPYFL ENDAEAASAA TAAGKSTDGV SESLNIQGEI LCGGAAADIA GRDFGGMNCV KPLAVVRPVG PEDIAGAVKA ALRSDKLTVA ARGNGHSING 101: QAMAEGGLVV DMSTTAENHF EVGYLSGGDA TAFVDVSGGA LWEDVLKRCV SEYGLAPRSW TDYLGLTVGG TLSNAGVSGQ AFRYGPQTSN VTELDVVTGN 201: GDVVTCSEIE NSELFFSVLG GLGQFGIITR ARVLLQPAPD MVRWIRVVYT EFDEFTQDAE WLVSQKNESS FDYVEGFVFV NGADPVNGWP TVPLHPDHEF 301: DPTRLPQSCG SVLYCLELGL HYRDSDSNST IDKRVERLIG RLRFNEGLRF EVDLPYVDFL LRVKRSEEIA KENGTWETPH PWLNLFVSKR DIGDFNRTVF 401: KELVKNGVNG PMLVYPLLRS RWDDRTSVVI PEEGEIFYIV ALLRFVPPCA KVSSVEKMVA QNQEIVHWCV KNGIDYKLYL PHYKSQEEWI RHFGNRWSRF 501: VDRKAMFDPM AILSPGQKIF NRSL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)