AT5G15120.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Protein of unknown function (DUF1637) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Protein of unknown function (DUF1637); FUNCTIONS IN: cysteamine dioxygenase activity; INVOLVED IN: anaerobic respiration; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 20 plant structures; EXPRESSED DURING: 8 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF1637 (InterPro:IPR012864); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Protein of unknown function (DUF1637) (TAIR:AT5G39890.1); Has 363 Blast hits to 363 proteins in 94 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 103; Fungi - 0; Plants - 225; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 35 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:4898814..4900351 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 33015.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.51 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.56 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 293 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGFEMKPEKE VLELISSKNQ CKSNPNSVKK KNKNKNKKMM MTWRRKKIDS PADGITAVRR LFNTCKEVFS NGGPGVIPSE DKIQQLREIL DDMKPEDVGL 101: TPTMPYFRPN SGVEARSSPP ITYLHLHQCD QFSIGIFCLP PSGVIPLHNH PGMTVFSKLL FGTMHIKSYD WVVDAPMRDS KTRLAKLKVD STFTAPCNAS 201: ILYPEDGGNM HRFTAITACA VLDVLGPPYC NPEGRHCTYF LEFPLDKLSS EDDDVLSSEE EKEGYAWLQE RDDNPEDHTN VVGALYRGPK VED |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)