AT5G12320.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.999 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ankyrin repeat family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
ankyrin repeat family protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ankyrin repeat-containing domain (InterPro:IPR020683), Ankyrin repeat (InterPro:IPR002110); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Ankyrin repeat family protein (TAIR:AT4G19150.1); Has 86458 Blast hits to 28632 proteins in 1360 species: Archae - 129; Bacteria - 7616; Metazoa - 44184; Fungi - 6856; Plants - 3179; Viruses - 915; Other Eukaryotes - 23579 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:3982762..3983899 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 15664.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 144 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGAETNGVAE KVDDLLEAAR YNDIDDLRTL ASDGLSLHSR DSQGRTALHM AAANGHMTIV EYLISEGVDI NALNDENNAP LHWACLNGHV EVVKRLILAG 101: ASLSLLNRYE RTPMDEAIGA EKMEIIDAIN TTVAQMELEN TSMT |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)