AT5G11710.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 0.500 vacuole 0.500 ASURE: golgi,vacuole What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ENTH/VHS family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
EPSIN1 plays an important role in the vacuolar trafficking of soluble proteins at the trans-Golgi network via its interaction with gamma-ADR, VTI11, VSR1, and clathrin. Associated with actin filaments and with the Golgi complex. Expressed in most tissues. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ENTH/VHS family protein; FUNCTIONS IN: binding; INVOLVED IN: protein targeting to vacuole; LOCATED IN: thylakoid, actin filament, Golgi apparatus; EXPRESSED IN: 26 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Epsin, N-terminal (InterPro:IPR001026), Epsin-like, N-terminal (InterPro:IPR013809), ENTH/VHS (InterPro:IPR008942); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: ENTH/VHS family protein (TAIR:AT2G43160.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:3772981..3776316 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 60637.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.64 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 560 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDFMKVFDQT VREIKREVNL KVLKVPEMEQ KVLDATDNEP WGPHGTALAE IAQATKKFSE CQMVMSVLWT RLSETGKDWR YVYKALAVID YLISNGSERA 101: VDEIIEHTYQ ISSLTSFEYV EPNGKDVGIN VRKKAENIVA LLNNKEKISE IRDKAVANRN KYVGLSSTGI TYKSGSSASF GGSFQSGSSN FDSYKDRDSR 201: EDKNDYESFQ KSRRGVKTEE QSYTSKKSFS RYGSTDHDNL SSGKKSPDSA KHRSYVSAAP SNNDDDFDDF DPRGTSSNKP STGSANQVDL FGGDLIGDFL 301: DSGPTETSST NNNENFQEAD LFADAAFVSA SAQGAEFGSQ TQKQVDLFSA SEPSVTVSSA PPTVDLFASS ESVVSPEAKI SIPESMATPN IVDPFAAVPM 401: DNFDGSDPFG AFTSHSASVS TGPQAPSVHG SATNTTSPLS FADSKPQHLQ KKDPFQVKSG IWADSLSRGL IDLNITAPKK ASLADVGVVG DLSNEDGNKA 501: SAASYYSGWS MGAGSGLGKT GLYSTQQQQQ QQQQQQAPDI SDDFFSSLSN QRYQSGGFKQ |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)