AT4G33100.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.618 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Mitochondrial distribution/morphology family 35/apoptosis (InterPro:IPR007918); Has 214 Blast hits to 214 proteins in 102 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 110; Fungi - 69; Plants - 29; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 6 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:15971701..15972342 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 10540.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.92 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.99 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 92 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
1: MGLLKKKDST SARSSTSPCA DLRNAYHNCF NKWYSEKFVK GQWDKEECVA EWKKYRDCLS ENLDGKLLTR ILEVDGELNP TKQATDSKES SS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)