AT4G30170.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Peroxidase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Peroxidase family protein; FUNCTIONS IN: peroxidase activity, heme binding; INVOLVED IN: oxidation reduction, response to oxidative stress; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: hypocotyl, root; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Haem peroxidase (InterPro:IPR010255), Plant peroxidase (InterPro:IPR000823), Peroxidases heam-ligand binding site (InterPro:IPR019793), Haem peroxidase, plant/fungal/bacterial (InterPro:IPR002016), Peroxidase, active site (InterPro:IPR019794); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Peroxidase superfamily protein (TAIR:AT2G18980.1); Has 4599 Blast hits to 4572 proteins in 303 species: Archae - 0; Bacteria - 4; Metazoa - 3; Fungi - 218; Plants - 4307; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 67 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:14762922..14764482 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 35830.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.37 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 325 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEKNTSQTIF SNFFLLLLLS SCVSAQLRTG FYQNSCPNVE TIVRNAVRQK FQQTFVTAPA TLRLFFHDCF VRGCDASIMI ASPSERDHPD DMSLAGDGFD 101: TVVKAKQAVD SNPNCRNKVS CADILALATR EVVVLTGGPS YPVELGRRDG RISTKASVQS QLPQPEFNLN QLNGMFSRHG LSQTDMIALS GAHTIGFAHC 201: GKMSKRIYNF SPTTRIDPSI NRGYVVQLKQ MCPIGVDVRI AINMDPTSPR TFDNAYFKNL QQGKGLFTSD QILFTDQRSR STVNSFANSE GAFRQAFITA 301: ITKLGRVGVL TGNAGEIRRD CSRVN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)