AT4G30120.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:vacuole 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : heavy metal atpase 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes a protein similar to Zn-ATPase, a P1B-type ATPases transport zinc | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
heavy metal atpase 3 (HMA3); FUNCTIONS IN: ATPase activity, coupled to transmembrane movement of ions, phosphorylative mechanism; INVOLVED IN: ATP biosynthetic process, metal ion transport; LOCATED IN: membrane; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Heavy metal transport/detoxification protein (InterPro:IPR006121), ATPase, P-type, ATPase-associated domain (InterPro:IPR008250), ATPase, P-type, K/Mg/Cd/Cu/Zn/Na/Ca/Na/H-transporter (InterPro:IPR001757), ATPase, P-type phosphorylation site (InterPro:IPR018303); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: heavy metal atpase 2 (TAIR:AT4G30110.1); Has 27689 Blast hits to 27671 proteins in 2971 species: Archae - 638; Bacteria - 20543; Metazoa - 1641; Fungi - 1310; Plants - 1204; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 2350 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:14731131..14733502 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 58645.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.54 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.36 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 542 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAEGEESKKM NLQTSYFDVV GICCSSEVSI VGNVLRQVDG VKEFSVIVPS RTVIVVHDTF LISPLQIVKA LNQARLEASV RPYGETSLKS QWPSPFAIVS 101: GVLLVLSFFK YFYSPLEWLA IVAVVAGVFP ILAKAVASVT RFRLDINALT LIAVIATLCM QDFTEAATIV FLFSVADWLE SSAAHKASIV MSSLMSLAPR 201: KAVIADTGLE VDVDEVGINT VVSVKAGESI PIDGVVVDGS CDVDEKTLTG ESFPVSKQRE STVMAATINL NGYIKVKTTA LARDCVVAKM TKLVEEAQKS 301: QTKTQRFIDK CSRYYTPAVV VSAACFAVIP VLLKVQDLSH WFHLALVVLV SGCPCGLILS TPVATFCALT KAATSGFLIK TGDCLETLAK IKIVAFDKTG 401: TITKAEFMVS DFRSLSPSIN LHKLLYWVSS IECKSSHPMA AALIDYARSV SVEPKPDIVE NFQNFPGEGV YGRIDGQDIY IGNKRIAQRA GCLTDNVPDI 501: EATMKRGKTI GYIYMGAKLT GSFNLLDGCR YGVAQALKEL KS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)