AT4G18760.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : receptor like protein 51 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
receptor like protein 51 (RLP51); INVOLVED IN: signal transduction; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: cultured cell; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Leucine-rich repeat (InterPro:IPR001611); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: receptor like protein 55 (TAIR:AT5G45770.1); Has 79225 Blast hits to 27308 proteins in 1069 species: Archae - 23; Bacteria - 3934; Metazoa - 14197; Fungi - 996; Plants - 54596; Viruses - 12; Other Eukaryotes - 5467 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:10308163..10309458 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 46073.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.68 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.02 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 431 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKPPSLPLLL LLLHLSATIS AAPSLSPTPS PTTSPIPPHK PSSSSSPLDP KQLKALESLN IPTVKDPCNH RPTTKSTSSS VVTCDTSSPF RLVTSISFTN 101: CSTDLSISTT ALRALSPSLT SLSFLNCPSL SPPPRLPDSL HSFTAVSSFL RRRNGLSGVF LARLVNLTDL TVSSVPVSTS GLFVILGNMH EIVSLTISHA 201: NLSGNIPKSF HSNLTFIDLS DNLLKGSIPT SITLLSNLKS LNLSKNTISG DIPDSIGDLI SLKNLSLSSN KLSGPIPDSI SSIPELTHLD LSGNQLNGTI 301: PRFISKMKYL THLNLANNAF HGVLPFNASF IKNLEVFKIG GNSDLCYNHS VLSSKMKLGI AQCDKHGLPL SPPPQKEDSN SDYDYGNEDD TSEKKKEEHH 401: GPNKVVLGVA IGLSSLVFLI IFMILLAKWC G |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)