AT4G14710.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : RmlC-like cupins superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
ATARD2; FUNCTIONS IN: acireductone dioxygenase [iron(II)-requiring] activity, metal ion binding; INVOLVED IN: L-methionine salvage from methylthioadenosine, oxidation reduction; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: cultured cell; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cupin, RmlC-type (InterPro:IPR011051), Acireductone dioxygenase, ARD (InterPro:IPR004313), RmlC-like jelly roll fold (InterPro:IPR014710); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: acireductone dioxygenase 1 (TAIR:AT4G14716.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:8424897..8426360 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 23357.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.76 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.66 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 199 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGEVVKDGRE EVIQAWYMDD SEEDQRLPHH KDPKEFLSLD KLAELGVLSW RLDADNYETD EDLKKIRESR GYSYMDFCEV CPEKLPNYEV KVKSFFEEHL 101: HTDEEIRYCV AGSGYFDVRD RNEAWIRVWV KKGGMIVLPA GIYHRFTVDS DNYIKAMRLF VGEPVWTPYN RPHDHLPARK EYIDNFVKVN EGGVIDASA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)