AT4G09650.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ATP synthase delta-subunit gene | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes the chloroplast ATPase delta-subunit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ATP synthase delta-subunit gene (ATPD); FUNCTIONS IN: hydrogen ion transporting ATP synthase activity, rotational mechanism; INVOLVED IN: response to cold, defense response to bacterium, photosynthetic electron transport in photosystem I, photosynthetic electron transport in photosystem II, photosynthesis; LOCATED IN: in 7 components; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: ATPase, F1 complex, OSCP/delta subunit, conserved site (InterPro:IPR020781), ATPase, F1 complex, OSCP/delta subunit (InterPro:IPR000711); Has 4372 Blast hits to 4372 proteins in 1436 species: Archae - 0; Bacteria - 2635; Metazoa - 155; Fungi - 114; Plants - 153; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1315 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:6100799..6101503 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 25670.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.69 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.05 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 234 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASLQQTLFS LQSKLPPSSF QIARSLPLRK TFPIRINNGG NAAGARMSAT AASSYAMALA DVAKRNDTME LTVTDIEKLE QVFSDPQVLN FFANPTITVE 101: KKRQVIDDIV KSSSLQSHTS NFLNVLVDAN RINIVTEIVK EFELVYNKLT DTQLAEVRSV VKLEAPQLAQ IAKQVQKLTG AKNVRVKTVI DASLVAGFTI 201: RYGESGSKLI DMSVKKQLED IASQLELGEI QLAT |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)