AT4G04960.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 0.903 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Concanavalin A-like lectin protein kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Concanavalin A-like lectin protein kinase family protein; FUNCTIONS IN: kinase activity; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 12 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Legume lectin, beta chain (InterPro:IPR001220), Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Concanavalin A-like lectin/glucanase, subgroup (InterPro:IPR013320), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Concanavalin A-like lectin/glucanase (InterPro:IPR008985); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Concanavalin A-like lectin protein kinase family protein (TAIR:AT4G28350.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:2533096..2535156 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 76697.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.64 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.02 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 686 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKALLFLLTL FLILPNPISA IDFIFNGFND SSSNVSLFGI ATIESKILTL TNQTSFATGR ALYNRTIRTK DPITSSVLPF STSFIFTMAP YKNTLPGHGI 101: VFLFAPSTGI NGSSSAQHLG LFNLTNNGNP SNHIFGVEFD VFANQEFSDI DANHVGIDVN SLHSVYSNTS GYWSDDGVVF KPLKLNDGRN YQVWIDYRDF 201: VVNVTMQVAG KIRPKIPLLS TSLNLSDVVE DEMFVGFTAA TGRLVQSHKI LAWSFSNSNF SLSNSLITTG LPSFVLPKDS IVKAKWFVFV LVLICFLVVA 301: LVGLVLFAVV RKRLERARKR ALMEDWEMEY WPHRIPYEEI ESGTKGFDEK NVIGIGGNGK VYKGLLQGGV VEVAVKRISQ ESSDGMREFV AEISSLGRLK 401: HRNLVSLRGW CKKEVGSFML VYDYMENGSL DRWIFENDEK ITTLSCEERI RILKGVASGI LYLHEGWESK VLHRDIKASN VLLDRDMIPR LSDFGLARVH 501: GHEQPVRTTR VVGTAGYLAP EVVKTGRAST QTDVFAYGIL VLEVMCGRRP IEEGKKPLMD WVWGLMERGE ILNGLDPQMM MTQGVTEVID EAERVLQLGL 601: LCAHPDPAKR PSMRQVVQVF EGDKAEIFEA ESSEDVESWM LMKMGSRGSS REFWYGSSSH PTIEQIRLQS LSVSLSSWNS SILEGR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)