AT3G58840.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Tropomyosin-related | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Tropomyosin-related; LOCATED IN: mitochondrion, plastid; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 10 growth stages; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Tropomyosin-related (TAIR:AT1G06530.1); Has 153429 Blast hits to 70272 proteins in 3237 species: Archae - 2904; Bacteria - 24810; Metazoa - 70427; Fungi - 12541; Plants - 7497; Viruses - 710; Other Eukaryotes - 34540 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:21757499..21758455 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 36597.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.56 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.95 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 318 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MADVEDRAAK GISDYDQGGV KTTELERKIE DMENKNQELT RENRELKERL ERLTGEIEEM KDVEAEMNQR FGEMEKEIEE YEEEKKALEA ISTRAVELET 101: EVSNLHDDLI TSLNGVDKTA EEVAELKKAL AEIVEKLEGC EKEAEGLRKD RAEVEKRVRD LERKIGVLEV REMEEKSKKL RSEEEMREID DEKKREIEEL 201: QKTVIVLNLE LVKNVEELKK WKSKKKLTEE ALSETQKREK ELELKKDELL KKVEEGNKTV FALNERTMKP SNGVRDTNGG DQKGSLEAEY QWPVVAAGSV 301: GAAGLVAATF FVCYSKLR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)