AT3G57530.1
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min: :max .
SUBAcon:plasma membrane 1.000 ASURE: plasma membrane What is SUBAcon? |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description (TAIR10) | protein_coding : calcium-dependent protein kinase 32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Curator Summary (TAIR10) |
Calcium-dependent Protein Kinase. ABA signaling component that regulates the ABA-responsive gene expression via ABF4. AtCPK32 has autophosphorylation activity and can phosphorylate ABF4 in vitro | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Computational Description (TAIR10) |
calcium-dependent protein kinase 32 (CPK32); FUNCTIONS IN: protein binding, calcium-dependent protein kinase C activity, calmodulin-dependent protein kinase activity, kinase activity; INVOLVED IN: response to salt stress, protein amino acid phosphorylation, N-terminal protein myristoylation, abscisic acid mediated signaling pathway; LOCATED IN: nucleus, plasma membrane, cytoplasm; EXPRESSED IN: 26 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), EF-Hand 1, calcium-binding site (InterPro:IPR018247), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), Calcium-binding EF-hand (InterPro:IPR002048), EF-hand-like domain (InterPro:IPR011992), EF-hand (InterPro:IPR018248), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), EF-HAND 2 (InterPro:IPR018249), Calcium-dependent protein kinase (InterPro:IPR020642), Tyrosine-protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR020635), Calcium/calmodulin-dependent protein kinase-like (InterPro:IPR020636); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: calcium-dependent protein kinase 14 (TAIR:AT2G41860.1); Has 119294 Blast hits to 116101 proteins in 3724 species: Archae - 161; Bacteria - 14072; Metazoa - 45815; Fungi - 14807; Plants - 21931; Viruses - 443; Other Eukaryotes - 22065 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Coordinates (TAIR10) | chr3:-:21296898..21299351 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Weight (calculated) | 60938.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IEP (calculated) | 6.36 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GRAVY (calculated) | -0.51 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Length | 538 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGNCCGTAGS LAQNDNKPKK GRKKQNPFSI DYGLHHGGGD GGGRPLKLIV LNDPTGREIE SKYTLGRELG RGEFGVTYLC TDKETDDVFA CKSILKKKLR 101: TAVDIEDVRR EVEIMRHMPE HPNVVTLKET YEDEHAVHLV MELCEGGELF DRIVARGHYT ERAAAAVTKT IMEVVQVCHK HGVMHRDLKP ENFLFGNKKE 201: TAPLKAIDFG LSVFFKPGER FNEIVGSPYY MAPEVLKRNY GPEVDIWSAG VILYILLCGV PPFWAETEQG VAQAIIRSVL DFRRDPWPKV SENAKDLIRK 301: MLDPDQKRRL TAQQVLDHPW LQNAKTAPNV SLGETVRARL KQFTVMNKLK KRALRVIAEH LSDEEASGIR EGFQIMDTSQ RGKINIDELK IGLQKLGHAI 401: PQDDLQILMD AGDIDRDGYL DCDEFIAISV HLRKMGNDEH LKKAFAFFDQ NNNGYIEIEE LREALSDELG TSEEVVDAII RDVDTDKDGR ISYEEFVTMM 501: KTGTDWRKAS RQYSRERFNS ISLKLMQDAS LQVNGDTR |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
See Also |
|
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)