AT3G50750.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : BES1/BZR1 homolog 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
BES1/BZR1 homolog 1 (BEH1); FUNCTIONS IN: transcription regulator activity; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: vacuole; EXPRESSED IN: 17 plant structures; EXPRESSED DURING: 12 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: BZR1, transcriptional repressor (InterPro:IPR008540); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Brassinosteroid signalling positive regulator (BZR1) family protein (TAIR:AT1G75080.2); Has 1801 Blast hits to 330 proteins in 47 species: Archae - 0; Bacteria - 4; Metazoa - 13; Fungi - 27; Plants - 263; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1494 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:18862147..18863062 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 30113.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.78 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.69 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 276 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTASGGGSTA ATGRMPTWKE RENNKKRERR RRAIAAKIFT GLRSQGNYKL PKHCDNNEVL KALCLEAGWI VHEDGTTYRK GSRPTETTVP CSSIQLSPQS 101: SAFQSPIPSY QASPSSSSYP SPTRFDPNQS STYLIPYLQN LASSGNLAPL RISNSAPVTP PISSPRRSNP RLPRWQSSNF PVSAPSSPTR RLHHYTSIPE 201: CDESDVSTVD SCRWGNFQSV NVSQTCPPSP TFNLVGKSVS SVGVDVSVKP WEGEKIHDVG IDDLELTLGH NTKGRG |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)