AT3G28340.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : galacturonosyltransferase-like 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein with putative galacturonosyltransferase activity. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
galacturonosyltransferase-like 10 (GATL10); FUNCTIONS IN: transferase activity, transferring hexosyl groups, polygalacturonate 4-alpha-galacturonosyltransferase activity; INVOLVED IN: carbohydrate biosynthetic process; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 20 plant structures; EXPRESSED DURING: 11 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glycosyl transferase, family 8 (InterPro:IPR002495); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: glucosyl transferase family 8 (TAIR:AT1G70090.2); Has 2215 Blast hits to 2207 proteins in 459 species: Archae - 2; Bacteria - 1092; Metazoa - 267; Fungi - 4; Plants - 737; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 113 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:10589396..10590493 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 41179.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.34 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 365 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MMSGSRLASR LIIIFSIIST SFFTVESIRL FPDSFDDASS DLMEAPAYQN GLDCSVLAKN RLLLACDPSA VHIAMTLDPA YLRGTVSAVH SILKHTSCPE 101: NIFFHFIASG TSQGSLAKTL SSVFPSLSFK VYTFEETTVK NLISSSIRQA LDSPLNYARS YLSEILSSCV SRVIYLDSDV IVVDDIQKLW KISLSGSRTI 201: GAPEYCHANF TKYFTDSFWS DQKLSSVFDS KTPCYFNTGV MVIDLERWRE GDYTRKIENW MKIQKEDKRI YELGSLPPFL LVFGGDIEAI DHQWNQHGLG 301: GDNIVSSCRS LHPGPVSLIH WSGKGKPWVR LDDGKPCPID YLWAPYDLHK SQRQYLQYNQ ELEIL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)