AT3G22942.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 ASURE: plasma membrane What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : G-protein gamma subunit 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
heterotrimeric G-protein gamma subunit 2(AGG2) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
G-protein gamma subunit 2 (AGG2); FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: basipetal auxin transport, seed germination, lateral root development; LOCATED IN: plasma membrane, heterotrimeric G-protein complex; EXPRESSED IN: hydathode, root cortex, root epidermis, differentiation zone, guard cell; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Ggamma-subunit 1 (TAIR:AT3G63420.2); Has 82 Blast hits to 82 proteins in 13 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 82; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:8134475..8135667 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 11140.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.50 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.79 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 100 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
1: MEAGSSNSSG QLSGRVVDTR GKHRIQAELK RLEQEARFLE EELEQLEKMD NASASCKEFL DSVDSKPDPL LPETTGPVNA TWDQWFEGPK EAKRCGCSIL | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)