AT3G18080.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : B-S glucosidase 44 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
B-S glucosidase 44 (BGLU44); FUNCTIONS IN: in 6 functions; INVOLVED IN: carbohydrate metabolic process; LOCATED IN: cytosolic ribosome, cell wall, plant-type cell wall; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glycoside hydrolase, family 1 (InterPro:IPR001360), Glycoside hydrolase, catalytic core (InterPro:IPR017853), Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core (InterPro:IPR013781); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: beta glucosidase 43 (TAIR:AT3G18070.1); Has 11220 Blast hits to 10898 proteins in 1459 species: Archae - 142; Bacteria - 7700; Metazoa - 714; Fungi - 202; Plants - 1462; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1000 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:6191586..6194124 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 58986.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.82 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.48 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 512 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MRHLSSPPWP LLLLLLLSSF TSGESSLSAE KNKLHTGGLS RQSFPKGFVF GTATSAYQVE GETHQDGRGP SIWDAFVKIP GKIAKNATAE ITVDQYHRYK 101: EDVDLMKKLN FDAYRFSISW SRIFPEGSGK VNWKGVAYYN RLIDYMVQKG ITPYANLYHY DLPLALENKY KGLLGRQVVK DFADYAEFCY KTFGDRVKNW 201: MTFNEPRVVA ALGYDNGIFA PGRCSKAFGN CTEGNSATEP YIVTHHLILA HAAAVQRYRK YYQAKQKGRV GILLDFVWYE PLTRSKADNL AAQRARDFHI 301: GWFIHPLVYG EYPKTMQNIV KERLPKFTEK EVKMVKGSID FVGINQYTTY YMSEPHPTTK PKDLGYQQDW NVEFGFAKLG KPIGPRAYSS WLYNVPWGMY 401: KALMYMKERY GNPTMILSEN GMDDPGNVTL AQGLHDTTRI KYYKDYLTNL KKARDDGANV VGYFAWSLLD NFEWLSGYTS RFGIVYVDYK TLKRYPKMSA 501: QWFKQLLKRN NK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)