AT3G12040.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.507 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : DNA-3-methyladenine glycosylase (MAG) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
DNA-3-methyladenine glycosylase (MAG); FUNCTIONS IN: DNA binding, alkylbase DNA N-glycosylase activity, catalytic activity; INVOLVED IN: base-excision repair; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Methylpurine-DNA glycosylase (MPG) (InterPro:IPR003180), Formyl transferase, C-terminal-like (InterPro:IPR011034); Has 2384 Blast hits to 2384 proteins in 1044 species: Archae - 26; Bacteria - 1995; Metazoa - 85; Fungi - 6; Plants - 30; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 242 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:3835349..3836781 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 28135.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.75 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.34 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 254 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKTPARRSKR VNQEESETNV TTRVVLRTRK TNCSKTRAAR VRPDYPLTRT TSESEMKLMP PEFFQIDALD LAPRLLGKFM RRDNVVLRIT EVEAYRPNDS 101: ACHGRFGVTP RTAPVFGPGG HAYVYLCYGL HMMLNIVADK EGVGAAVLIR SCSPVSGMET IQERRGLKTD KPVLLNGPGK VGQALGLSTE WSHHPLYSPG 201: GLELLDGGED VEKVMVGPRV GIDYALPEHV NALWRFAVAD TPWISAPKNT LKPL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)