AT3G10570.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.889 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cytochrome P450, family 77, subfamily A, polypeptide 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
member of CYP77A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
cytochrome P450, family 77, subfamily A, polypeptide 6 (CYP77A6); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cytochrome P450 (InterPro:IPR001128), Cytochrome P450, E-class, group I (InterPro:IPR002401), Cytochrome P450, conserved site (InterPro:IPR017972); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cytochrome P450, family 77, subfamily A, polypeptide 4 (TAIR:AT5G04660.1); Has 33543 Blast hits to 33220 proteins in 1724 species: Archae - 51; Bacteria - 4053; Metazoa - 12037; Fungi - 6692; Plants - 9430; Viruses - 6; Other Eukaryotes - 1274 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:3302156..3303697 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 58233.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.99 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 513 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSILSFPHTF FNISPSLFYT ILISSLVLLI LTRRSAKSKI VKLPPGPPGW PVVGNLFQFA RSGKQFYEYV DDVRKKYGPI YTLRMGSRTM IIISDSALVH 101: DVLIQRGPMF ATRPTENPTR TIFSSNTFTV NASAYGPVWR SLRKNMVQNM LSSIRFREFG SLRQSAMDKL VERIKSEAKD NDGLVWVLRN ARFAAFCILL 201: EMCFGIEMDE ESILNMDQVM KKVLITLNPR LDDYLPILAP FYSKERARAL EVRCEQVDFI VKLIERRRRA IQKPGTDKTA SSFSYLDTLF DLKTEGRITT 301: PSNEELVSLC SEFLNGGTDT TGTAIEWGIA QLIVNPEIQS RLYDEIKSTV GDREVEEKDV DKMVFLQAVV KEILRKHPPT YFTLTHSVTE PTTVAGYDVP 401: VGINVEFYLP GINEDPKLWS DPKKFNPDRF ISGKEEADIT GVTGVKMMPF GIGRRICPGL AMATVHVHLM LAKMVQEFEW SAYPPESEID FAGKLEFTVV 501: MKKPLRAMVK PRV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)