AT1G01600.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.756 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cytochrome P450, family 86, subfamily A, polypeptide 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a member of the CYP86A subfamily of cytochrome p450 genes. Expressed significantly at highest level in mature stems and flowers. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
cytochrome P450, family 86, subfamily A, polypeptide 4 (CYP86A4); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cytochrome P450 (InterPro:IPR001128), Cytochrome P450, conserved site (InterPro:IPR017972), Cytochrome P450, E-class, group I (InterPro:IPR002401); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cytochrome P450, family 86, subfamily A, polypeptide 2 (TAIR:AT4G00360.1); Has 27858 Blast hits to 27767 proteins in 1485 species: Archae - 44; Bacteria - 2493; Metazoa - 10417; Fungi - 6140; Plants - 7807; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 954 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:219200..220994 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 62606.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 554 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEISNAMLLV AIVTGYWLWF KRISRWLKGP RVWPLLGSLP GLIEQRDRMH EWITENLRAC GGTYQTCIFA VPFLAKKQGL VTVTCDPKNL EHMLKTRFDN 101: YPKGPTWQSV FHDLLGQGIF NSDGDTWLFQ RKTAALEFTT RTLRQAMGRW VNRGIKLRFC PILATAQDNA EPVDLQDLIL RLTFDNICGL AFGKDTRTCA 201: PGLPENGFAS AFDRATEASL QRFIIPKFMW KLKKWLGLGL EVSLSRSLGE IDEYLAAVIN TRKQELMSQQ ESGTHQRHDD LLSRFMMKKT ESYSDTFLQH 301: VALNFILAGR DTSSVALSWF FWLITMHPTV EDKIVREICS VLIETRGTDD VASWTEEPLG FDEIDRLVYL KAAISETLRL YPSVPEDSKH VENDDVLPDG 401: TFVPAGSSVT YSIYAAGRMK STWGEDCLEF NPERWISPID GKFINHDQYR FVAFNAGPRI CLGKDLAYLQ MKTIAAAVLL RHRLTVVPGH KVEQKMSLTL 501: FMKNGLLVNL YKRDLQGIIK SLVVKKSDGV SNGQCNGVIG EGVAVYLNTG VAVV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)