AT3G09410.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 0.999 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Pectinacetylesterase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Pectinacetylesterase family protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Pectinacetylesterase (InterPro:IPR004963); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Pectinacetylesterase family protein (TAIR:AT3G09405.1); Has 557 Blast hits to 548 proteins in 93 species: Archae - 0; Bacteria - 46; Metazoa - 119; Fungi - 0; Plants - 303; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 89 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:2898243..2900984 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 47639.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 427 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAIPRFSSLL RCRKWAKSDW LVASIGCVLI VFFLSFFFDP TSDSVPSVDR SRPIISPSDL VKLKLSSVAK ERGAFCLDGS LPGYHFHEGS GSGSQSWLVH 101: LEGGGWCNTV ASCSARALTK LGSSNYFEQE VAFQGVLSSD PSQNPEFFNW NKVAIRYCDG ASFSGRPEAE FKNGTRLFFR GQLIWEAIID ELLSMGMSDA 201: KQAILTGCSA GGLASLIHCD YFRDHLPKDA AVKCVSDGGY FLNVPDVLGN PTMRSFYHDV VNLQGVEKSL DQKCVAKTEP SKCMFPQEFL KNIRTPVFLV 301: NPAYDFWQIQ HVLVPTSADP DKSWAKCRLN IKECDAEQIK VLHGFRSSMM TAIGEFHQNK DGGMFIDSCY AHCQTVMSVT WHSLTSPRIE NKTIAESVGD 401: WYFNRKPVKL IDCPYPCNPS CYNMNFT |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)