AT3G07570.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.987 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Cytochrome b561/ferric reductase transmembrane with DOMON related domain | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Cytochrome b561/ferric reductase transmembrane with DOMON related domain; FUNCTIONS IN: dopamine beta-monooxygenase activity; INVOLVED IN: histidine catabolic process; LOCATED IN: membrane; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cytochrome b561, eukaryote (InterPro:IPR004877), DOMON related (InterPro:IPR005018), Cytochrome b561/ferric reductase transmembrane (InterPro:IPR006593), DOMON (InterPro:IPR013050); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Cytochrome b561/ferric reductase transmembrane with DOMON related domain (TAIR:AT3G61750.1); Has 561 Blast hits to 559 proteins in 100 species: Archae - 0; Bacteria - 4; Metazoa - 121; Fungi - 31; Plants - 384; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 21 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:2418205..2420206 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 40446.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.37 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 369 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKLYSVSIII FVLIALSTIV NAQQAATDSC NSTLPLNDLT FNTSLLQCTE AWTPQNFILR YARTAENTWS FILSAPDSSA FIGIGFSTNG QMIGSSAIVG 101: WIPSDGGSGT VKPYLLGGKS PGEVNPDQGD LTIVNGSLKI ESVSSRLYMR FQLTATLPRQ SLLYAVGPAG FFPSSPDFRL REHRFVTTTT INYNTGSQSV 201: VKVSPHSKLK KTHGLMNMFG WGILIIVGAI VARHMKQWDP TWFYAHIALQ TTGFLLGLTG VICGLVLENR LKANNVSKHK GLGITILVMG VLQMLALLAR 301: PDKQSKYRKY WNWYHHNIGR LLIILAISNI FYGIHLAKAG TSWNGGYGFA VAVLALTAIG LEVRKFLKK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)