AT3G03310.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:vacuole 0.891 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : lecithin:cholesterol acyltransferase 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
lecithin:cholesterol acyltransferase 3 (LCAT3); FUNCTIONS IN: phosphatidylcholine-sterol O-acyltransferase activity; INVOLVED IN: lipid metabolic process; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Lecithin:cholesterol acyltransferase (InterPro:IPR003386); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: alpha/beta-Hydrolases superfamily protein (TAIR:AT4G19860.1); Has 560 Blast hits to 555 proteins in 155 species: Archae - 2; Bacteria - 82; Metazoa - 189; Fungi - 22; Plants - 147; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 118 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:778767..781488 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 50351.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.98 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 447 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGWIPCPCWG TNDDENAGEV ADRDPVLLVS GIGGSILHSK KKNSKSEIRV WVRIFLANLA FKQSLWSLYN PKTGYTEPLD DNIEVLVPDD DHGLYAIDIL 101: DPSWFVKLCH LTEVYHFHDM IEMLVGCGYK KGTTLFGYGY DFRQSNRIDL LILGLKKKLE TAYKRSGGRK VTIISHSMGG LMVSCFMYLH PEAFSKYVNK 201: WITIATPFQG APGCINDSIL TGVQFVEGLE SFFFVSRWTM HQLLVECPSI YEMMANPDFK WKKQPEIRVW RKKSENDVDT SVELESFGLI ESIDLFNDAL 301: KNNELSYGGN KIALPFNFAI LDWAAKTREI LNKAQLPDGV SFYNIYGVSL NTPFDVCYGT ETSPIDDLSE ICQTMPEYTY VDGDGTVPAE SAAAAQFKAV 401: ASVGVSGSHR GLLRDERVFE LIQQWLGVEP KKAKRKHLRT HKVVDSG |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)