AT3G02770.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Ribonuclease E inhibitor RraA/Dimethylmenaquinone methyltransferase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Ribonuclease E inhibitor RraA/Dimethylmenaquinone methyltransferase; FUNCTIONS IN: ribonuclease inhibitor activity; INVOLVED IN: regulation of RNA metabolic process; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ribonuclease E inhibitor RraA/Dimethylmenaquinone methyltransferase (InterPro:IPR005493), Ribonuclease E inhibitor RraA (InterPro:IPR010203); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Ribonuclease E inhibitor RraA/Dimethylmenaquinone methyltransferase (TAIR:AT5G16450.2); Has 3340 Blast hits to 3340 proteins in 1050 species: Archae - 84; Bacteria - 2632; Metazoa - 2; Fungi - 51; Plants - 104; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 467 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:601017..601884 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 17837.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.76 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.08 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 166 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAFVTTAEVC DANQEMIRSG QLRALQPVFQ IYGRRQIFSG PVVTVKVFED NGLIRHFLEE KGNGRVLVVD GGGSLRCAIL GGNPVVQAQN NGWAGIIVNG 101: CIRDVDEING CDIGVRALAS HPIKASKKGL GEQRVSLNIA GTRICDGEWL YADTDGILVS QIELSV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)