AT2G46200.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
unknown protein; Has 2968 Blast hits to 2381 proteins in 310 species: Archae - 16; Bacteria - 188; Metazoa - 1070; Fungi - 227; Plants - 145; Viruses - 4; Other Eukaryotes - 1318 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:18974864..18976646 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 44033.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.89 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 382 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MNPANFQPPN PPFHWAPMLP PDPPRCGMFW NTKNITDQLK QLQDTLNLAK SMEKELEALK MIKDAKGSVE NAVQDSGVEY LEARKMDLGQ QEMLSVDAAN 101: SLMSTLRAQL EPFRFVVDEN SPWEEKSAAV RLTCKMKKSI RNKLWKKRKR RCAAEMRAKE PERFEQADRE ADEWREKEMA KDMANRKVDE MKAIEKIKAK 201: RERKRLEPEL ELALIVEEMQ ELRSLRIEKL KKQGHFLPEE DDKFFESVRA AVEQEENQAQ SLINTETEEH VIASEENTTL TTSNKTNNDT DKDSNTNAAS 301: CERTMKAPDN GCDNISNLPV EVYHYYYGSN IDMGRLIEIR REWDAYLSAG GSRIPGHWVQ PSPPANEIWA SCLVNTPKRD LS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)