AT2G44450.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : beta glucosidase 15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
beta glucosidase 15 (BGLU15); FUNCTIONS IN: cation binding, hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds, catalytic activity; INVOLVED IN: carbohydrate metabolic process; LOCATED IN: cell wall, plant-type cell wall; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glycoside hydrolase, family 1 (InterPro:IPR001360), Glycoside hydrolase, family 1, active site (InterPro:IPR018120), Glycoside hydrolase, catalytic core (InterPro:IPR017853), Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core (InterPro:IPR013781); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: beta glucosidase 13 (TAIR:AT5G44640.1); Has 11372 Blast hits to 11030 proteins in 1475 species: Archae - 142; Bacteria - 7834; Metazoa - 716; Fungi - 200; Plants - 1457; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1023 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:18340966..18343744 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 56908.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.82 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.35 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 506 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MRGNYLSLLV VLIVLASNDV LANNNSSTPK LRRSDFPEDF IFGSATSAYQ VEGGAHEDGR GPSIWDTFSE KYPEKIKDGS NGSVADNSYH LYKEDVALLH 101: QIGFNAYRFS ISWSRILPRG NLKGGINQAG IDYYNNLINE LLSKGIKPFA TMFHWDTPQA LEDAYGGFRG AEIVNDFRDY ADICFKNFGD RVKHWMTLNE 201: PLTVVQQGYV AGVMAPGRCS KFTNPNCTDG NGATEPYIVG HNLILSHGAA VQVYREKYKA SQQGQVGIAL NAGWNLPYTE SPKDRLAAAR AMAFTFDYFM 301: EPLVTGKYPV DMVNNVKGRL PIFTAQQSKM LKGSYDFIGI NYYSSTYAKD VPCSTKDVTM FSDPCASVTG ERDGVPIGPK AASDWLLIYP KGIRDLVLYA 401: KYKFKDPVMY ITENGRDEFS TNKIFLKDGD RIDYYARHLE MVQDAISVGA NVKGFFAWSL LDNFEWAMGY TVRFGLVYVD FKDGCKRYPK KSAEWFRKLL 501: NEKKND |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)