AT2G39795.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Mitochondrial glycoprotein family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Mitochondrial glycoprotein family protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Mitochondrial glycoprotein (InterPro:IPR003428); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Mitochondrial glycoprotein family protein (TAIR:AT3G55605.1); Has 404 Blast hits to 404 proteins in 130 species: Archae - 0; Bacteria - 2; Metazoa - 6; Fungi - 117; Plants - 220; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 59 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:16597026..16598028 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 28062.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.46 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.45 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 250 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MALAWCVVRR SASKFASVYG GRVRSISAVA NRASLARNPS SIRPFVSRAL NYSTAIDRIS SEQTLIRVID SEINSALQSD NIDSDEEMTP GSFPFRIEDK 101: PGNQNVTLTR DYNGEHIKVV VSMPSLVSDE NDDDDDDDEG PSNESSIPLV VTVTKKSGLT LEFSCMAFPD EIAIDALSVK HPGDSLEDQL ANEGPDFEDL 201: DENLKKTFYK FLEIRGVKAS TTNFLHEYMT RKVNREYFLW LKNVKEFMEQ |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)