AT2G37250.1
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min: :max .
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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Description (TAIR10) | protein_coding : adenosine kinase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Curator Summary (TAIR10) |
encodes adenylate kinase that is located in the chloroplast involved in the coordination of metabolism and growth | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Computational Description (TAIR10) |
adenosine kinase (ADK); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Adenylate kinase, subfamily (InterPro:IPR006259), Adenylate kinase (InterPro:IPR000850); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein (TAIR:AT2G39270.1); Has 14783 Blast hits to 14646 proteins in 5115 species: Archae - 103; Bacteria - 9935; Metazoa - 1161; Fungi - 479; Plants - 468; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2637 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Annotations |
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Coordinates (TAIR10) | chr2:+:15641991..15643318 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Weight (calculated) | 31040.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IEP (calculated) | 6.67 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GRAVY (calculated) | -0.27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Length | 284 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MARLVRVARS SSLFGFGNRF YSTSAEASHA SSPSPFLHGG GASRVAPKDR NVQWVFLGCP GVGKGTYASR LSTLLGVPHI ATGDLVREEL ASSGPLSQKL 101: SEIVNQGKLV SDEIIVDLLS KRLEAGEARG ESGFILDGFP RTMRQAEILG DVTDIDLVVN LKLPEEVLVD KCLGRRTCSQ CGKGFNVAHI NLKGENGRPG 201: ISMDPLLPPH QCMSKLVTRA DDTEEVVKAR LRIYNETSQP LEEYYRTKGK LMEFDLPGGI PESWPRLLEA LRLDDYEEKQ SVAA |
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See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)