AT5G63400.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : adenylate kinase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes a protein similar to adenylate kinase. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
adenylate kinase 1 (ADK1); FUNCTIONS IN: copper ion binding, adenylate kinase activity; INVOLVED IN: response to cadmium ion; LOCATED IN: mitochondrion, plasma membrane; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Adenylate kinase, active site lid domain (InterPro:IPR007862), Adenylate kinase, subfamily (InterPro:IPR006259), Adenylate kinase (InterPro:IPR000850); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Adenylate kinase family protein (TAIR:AT5G50370.1); Has 15080 Blast hits to 14911 proteins in 5099 species: Archae - 98; Bacteria - 9942; Metazoa - 1275; Fungi - 473; Plants - 468; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2824 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:25393274..25394817 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 26933.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.45 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.39 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 246 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MATGGAAADL EDVQTVDLMS ELLRRLKCSQ KPDKRLIFIG PPGSGKGTQS PVVKDEYCLC HLSTGDMLRA AVASKTPLGV KAKEAMEKGE LVSDDLVVGI 101: IDEAMNKPKC QKGFILDGFP RTVTQAEKLD EMLKRRGTEI DKVLNFAIDD AILEERITGR WIHPSSGRSY HTKFAPPKTP GVDDITGEPL IQRKDDNADV 201: LKSRLAAFHS QTQPVIDYYA KKAVLTNIQA EKAPQEVTSE VKKALS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)