AT2G29740.1
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min: :max .
SUBAcon:plasma membrane 0.986 What is SUBAcon? |
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Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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Description (TAIR10) | protein_coding : UDP-glucosyl transferase 71C2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Curator Summary (TAIR10) |
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Computational Description (TAIR10) |
UDP-glucosyl transferase 71C2 (UGT71C2); FUNCTIONS IN: quercetin 3-O-glucosyltransferase activity, quercetin 3'-O-glucosyltransferase activity, UDP-glycosyltransferase activity, quercetin 7-O-glucosyltransferase activity, transferase activity, transferring glycosyl groups; INVOLVED IN: metabolic process; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: hypocotyl, root; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase (InterPro:IPR002213); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: UDP-glucosyl transferase 71C1 (TAIR:AT2G29750.1); Has 7391 Blast hits to 7346 proteins in 369 species: Archae - 0; Bacteria - 193; Metazoa - 2136; Fungi - 25; Plants - 4947; Viruses - 29; Other Eukaryotes - 61 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Annotations |
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Coordinates (TAIR10) | chr2:+:12706747..12708171 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Weight (calculated) | 53188.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IEP (calculated) | 4.76 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GRAVY (calculated) | 0.03 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Length | 474 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAKQQEAELI FIPFPIPGHI LATIELAKRL ISHQPSRIHT ITILHWSLPF LPQSDTIAFL KSLIETESRI RLITLPDVQN PPPMELFVKA SESYILEYVK 101: KMVPLVRNAL STLLSSRDES DSVHVAGLVL DFFCVPLIDV GNEFNLPSYI FLTCSASFLG MMKYLLERNR ETKPELNRSS DEETISVPGF VNSVPVKVLP 201: PGLFTTESYE AWVEMAERFP EAKGILVNSF ESLERNAFDY FDRRPDNYPP VYPIGPILCS NDRPNLDLSE RDRILKWLDD QPESSVVFLC FGSLKSLAAS 301: QIKEIAQALE LVGIRFLWSI RTDPKEYASP NEILPDGFMN RVMGLGLVCG WAPQVEILAH KAIGGFVSHC GWNSILESLR FGVPIATWPM YAEQQLNAFT 401: IVKELGLALE MRLDYVSEYG EIVKADEIAG AVRSLMDGED VPRRKLKEIA EAGKEAVMDG GSSFVAVKRF IDGL |
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See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)