AT2G19590.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ACC oxidase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes a protein whose sequence is similar to 1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ACC oxidase 1 (ACO1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Oxoglutarate/iron-dependent oxygenase (InterPro:IPR005123); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: 2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein (TAIR:AT1G12010.1); Has 7815 Blast hits to 7777 proteins in 927 species: Archae - 0; Bacteria - 960; Metazoa - 67; Fungi - 764; Plants - 4878; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1146 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:8476239..8477354 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 35204.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.61 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.49 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 310 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVLIKEREME IPVIDFAELD GEKRSKTMSL LDHACDKWGF FMVDNHGIDK ELMEKVKKMI NSHYEEHLKE KFYQSEMVKA LSEGKTSDAD WESSFFISHK 101: PTSNICQIPN ISEELSKTMD EYVCQLHKFA ERLSKLMCEN LGLDQEDIMN AFSGPKGPAF GTKVAKYPEC PRPELMRGLR EHTDAGGIIL LLQDDQVPGL 201: EFFKDGKWVP IPPSKNNTIF VNTGDQLEIL SNGRYKSVVH RVMTVKHGSR LSIATFYNPA GDAIISPAPK LLYPSGYRFQ DYLKLYSTTK FGDKGPRLET 301: MKKMGNADSA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)