AT2G18570.1
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min: :max .
SUBAcon:plasma membrane 0.928 What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description (TAIR10) | protein_coding : UDP-Glycosyltransferase superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Curator Summary (TAIR10) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Computational Description (TAIR10) |
UDP-Glycosyltransferase superfamily protein; FUNCTIONS IN: transferase activity, transferring glycosyl groups; INVOLVED IN: metabolic process; LOCATED IN: cellular_component unknown; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase (InterPro:IPR002213); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: UDP-Glycosyltransferase superfamily protein (TAIR:AT2G18560.1); Has 35333 Blast hits to 34131 proteins in 2444 species: Archae - 798; Bacteria - 22429; Metazoa - 974; Fungi - 991; Plants - 531; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9610 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Coordinates (TAIR10) | chr2:+:8063429..8064841 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Weight (calculated) | 51915.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IEP (calculated) | 4.82 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GRAVY (calculated) | 0.01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Length | 470 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDQPHALLVA SPGLGHLIPI LELGNRLSSV LNIHVTILAV TSGSSSPTET EAIHAAAART ICQITEIPSV DVDNLVEPDA TIFTKMVVKM RAMKPAVRDA 101: VKLMKRKPTV MIVDFLGTEL MSVADDVGMT AKYVYVPTHA WFLAVMVYLP VLDTVVEGEY VDIKEPLKIP GCKPVGPKEL METMLDRSGQ QYKECVRAGL 201: EVPMSDGVLV NTWEELQGNT LAALREDEEL SRVMKVPVYP IGPIVRTNQH VDKPNSIFEW LDEQRERSVV FVCLGSGGTL TFEQTVELAL GLELSGQRFV 301: WVLRRPASYL GAISSDDEQV SASLPEGFLD RTRGVGIVVT QWAPQVEILS HRSIGGFLSH CGWSSALESL TKGVPIIAWP LYAEQWMNAT LLTEEIGVAV 401: RTSELPSERV IGREEVASLV RKIMAEEDEE GQKIRAKAEE VRVSSERAWS KDGSSYNSLF EWAKRCYLVP |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
See Also |
|
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)