AT2G03430.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Ankyrin repeat family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Ankyrin repeat family protein; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: cell wall; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ankyrin repeat-containing domain (InterPro:IPR020683), Ankyrin repeat (InterPro:IPR002110); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: ankyrin repeat protein (TAIR:AT5G66055.1); Has 130068 Blast hits to 38689 proteins in 1585 species: Archae - 162; Bacteria - 14649; Metazoa - 59864; Fungi - 13189; Plants - 7735; Viruses - 2061; Other Eukaryotes - 32408 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:1036192..1037536 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 25922.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.83 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 240 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEIATDTAKQ MRDEELFKAA EWGDSSLFMS LSEEQLSKSL NFRNEDGRSL LHVAASFGHS QIVKLLSSSD EAKTVINSKD DEGWAPLHSA ASIGNAELVE 101: VLLTRGADVN AKNNGGRTAL HYAASKGRLE IAQLLLTHGA KINITDKVGC TPLHRAASVG KLEVCEFLIE EGAEIDATDK MGQTALMHSV ICDDKQVAFL 201: LIRHGADVDV EDKEGYTVLG RATNEFRPAL IDAAKAMLEG |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)