AT1G80370.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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| FP Images |
7-day old Arabidopsis seedling (no marker)
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Cyclin A2;4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Cyclin A2;4 (CYCA2;4); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cyclin, C-terminal (InterPro:IPR004367), Cyclin (InterPro:IPR006670), G2/mitotic-specific cyclin A (InterPro:IPR015453), Cyclin-like (InterPro:IPR011028), Cyclin-related (InterPro:IPR013763), Cyclin, N-terminal (InterPro:IPR006671), Cyclin, A/B/D/E (InterPro:IPR014400); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: CYCLIN A2;3 (TAIR:AT1G15570.1); Has 4103 Blast hits to 4099 proteins in 369 species: Archae - 0; Bacteria - 2; Metazoa - 1911; Fungi - 542; Plants - 1008; Viruses - 34; Other Eukaryotes - 606 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:30214694..30216861 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 51639.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.03 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 461 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGKENAVSGN SIPIHGRPVT RALASALRAS SKLITSSEVA ATTQNQGRVL RAKSKRTALD EKKANAPKKR AVLKDITNVT CENSYTSCFS VAVENIKQIK 101: KGRQSSSSSK VASSSATSQV TDAKVEVVSN SAGASLSVFT DTSLGTNETS YSIIAKPSSR SPPRPFGTVE RSCGGASSPK FVDIDSDDKD PLLCSLYAPD 201: IYYNLRVAEL KRRPFPDFME KTQRDVTETM RGILVDWLVE VSEEYTLVPD TLYLTVYLID WFLHGNYVER QRLQLLGITC MLIASKYEEI HAPRIEEFCF 301: ITDNTYTRDQ VLEMESQVLK HFSFQIYTPT SKTFLRRFLR AAQVSFPNQS LEMEFLANYL TELTLMDYPF LKFLPSIIAA SAVFLAKWTL NQSSHPWNPT 401: LEHYTTYKAS DLKASVHALQ DLQLNTKGCS LNSIRMKYRQ DKFKSVAVFS SGELPDKLFI S |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)