AT1G78680.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:vacuole 1.000 ASURE: vacuole What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : gamma-glutamyl hydrolase 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
The Arabidopsis protein AtGGH2 is a gamma-glutamyl hydrolase acting specifically on monoglutamates. The enzyme is involved in the tetrahydrofolate metabolism and located to the vacuole. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
gamma-glutamyl hydrolase 2 (GGH2); FUNCTIONS IN: omega peptidase activity; INVOLVED IN: tetrahydrofolylpolyglutamate metabolic process; LOCATED IN: vacuole; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Peptidase C26, gamma-glutamyl hydrolase (InterPro:IPR015527), Peptidase C26 (InterPro:IPR011697); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: gamma-glutamyl hydrolase 1 (TAIR:AT1G78660.2); Has 406 Blast hits to 402 proteins in 115 species: Archae - 3; Bacteria - 51; Metazoa - 191; Fungi - 0; Plants - 77; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 84 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:29593933..29596037 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 38644.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.06 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 347 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MWSYVWLPLV ALSLFKDSII MAKAATILLP SQTGFDISRS PVCSAPDPNL NYRPVIGILS HPGDGASGRL SNATDASSIA ASYVKLAESG GARVIPLIFN 101: EPEEILFQKL ELVNGVILTG GWAKEGLYFE IVKKIFNKVL ERNDAGEHFP IYAICLGFEL LTMIISQNRD IFEKMDARNS ASSLQFVENV NIQGTIFQRF 201: PPELLKKLGT DCLVMQNHRF GISPQSFEGN IALSNFFKIV TTCVDDNGKV YVSTVQSTKY PVTGFQWHPE KNAFEWGSSK IPHSEDAIQV TQHAANHLVS 301: EARKSLNRPE SKKVLSNLIY NYKPTYCGYA GIGYDEVYIF TQQRSLL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)