AT1G73150.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : global transcription factor group E3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Bromodomain and extra terminal domain family protein. Binds to acetyl-histone H3. Binding is reduced when GTE3 is SUMOylated by SIZ1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
global transcription factor group E3 (GTE3); FUNCTIONS IN: histone binding, DNA binding; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Bromodomain (InterPro:IPR001487); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: DNA-binding bromodomain-containing protein (TAIR:AT1G17790.1); Has 5728 Blast hits to 4631 proteins in 254 species: Archae - 0; Bacteria - 6; Metazoa - 3450; Fungi - 928; Plants - 599; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 745 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:27504327..27505996 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 50814.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.62 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 461 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASGPIAGGG VSKTKHKWSD SGNKSQKRSK PTVANSNSLG LEDNHQMMKI SLSSISKLEV RNLKRKLQAE LEEVRSLIKR LEPQGNNFAP VPNKKLKTAN 101: GGKKGGVHGA AADKGTVQIL KSCNNLLTKL MKHKSGWIFN TPVDVVTLGL HDYHNIIKEP MDLGTVKTRL SKSLYKSPLE FAEDVRLTFN NAMLYNPVGH 201: DVYHMAEILL NLFEEKWVPL ETQYELLIRK QQPVRDIDFH APVSTNTHNV EALPLPAPTP SLSPPPPPKV VENRTLERAE SMTNPVKPAV LPVVPEKLVE 301: EASANRDLTF DEKRQLSEDL QDLPYDKLEA VVQIIKKRTP ELSQQDDEIE LDIDSLDLET LWELFRFVTE YKESLSKKKE EQGLDSERDA ESFHNSVHES 401: NTLVTGLESS KVTELGHVAS TVRQEVNVGG SSSSNSSSSG SGSGSSGSDS DSSGHESDTG N |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)