AT1G54960.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : NPK1-related protein kinase 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
member of MEKK subfamily | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
NPK1-related protein kinase 2 (NP2); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Mitogen activated protein kinase kinase kinase 3 (InterPro:IPR015748), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Tyrosine-protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR020635); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: NPK1-related protein kinase 1 (TAIR:AT1G09000.1); Has 135537 Blast hits to 133200 proteins in 4901 species: Archae - 150; Bacteria - 15240; Metazoa - 51035; Fungi - 12941; Plants - 33422; Viruses - 585; Other Eukaryotes - 22164 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:20500058..20503587 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 66735.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.26 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.59 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 606 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVFAKSQSPP NNSTVQIKPP IRWRKGQLIG RGAFGTVYMG MNLDSGELLA VKQVLITSNC ASKEKTQAHI QELEEEVKLL KNLSHPNIVR YLGTVREDET 101: LNILLEFVPG GSISSLLEKF GAFPESVVRT YTNQLLLGLE YLHNHAIMHR DIKGANILVD NQGCIKLADF GASKQVAELA TISGAKSMKG TPYWMAPEVI 201: LQTGHSFSAD IWSVGCTVIE MVTGKAPWSQ QYKEIAAIFH IGTTKSHPPI PDNISSDAND FLLKCLQQEP NLRPTASELL KHPFVTGKQK ESASKDLTSF 301: MDNSCSPLPS ELTNITSYQT STSDDVGDIC NLGSLTCTLA FPEKSIQNNS LCLKSNNGYD DDDDNDMCLI DDENFLTYNG ETGPSLDNNT DAKKSCDTMS 401: EISDILKCKF DENSGNGETE TKVSMEVDHP SYSEDENELT ESKIKAFLDD KAAELKKLQT PLYEEFYNGM ITCSPICMES NINNNKREEA PRGFLKLPPK 501: SRSPSQGHIG RSPSRATDAA CCSKSPESGN SSGAPKNSNA SAGAEQESNS QSVALSEIER KWKEELDQEL ERKRREITRQ AGMGSSPRDR SLSRHREKSR 601: FASPGK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)