AT2G20635.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.999 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ATP binding;protein kinases;protein serine/threonine kinases | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
ATP binding;protein kinases;protein serine/threonine kinases; FUNCTIONS IN: protein serine/threonine kinase activity, protein kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: cellular_component unknown; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Mitotic checkpoint serine/threonine protein kinase, Bub1 (InterPro:IPR015661), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), Mad3/BUB1 homology region 1 (InterPro:IPR013212), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: BUB1-related (BUB1: budding uninhibited by benzymidazol 1) (TAIR:AT2G33560.1); Has 7386 Blast hits to 7115 proteins in 591 species: Archae - 30; Bacteria - 832; Metazoa - 2305; Fungi - 1186; Plants - 1328; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 1702 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:8900410..8903384 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 61126.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.82 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.45 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 525 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTIGYRDAAG DPLFPWLMEI KNSMEDLYAG KNSGYDLDKL LFDCISTYKK DSRYRNDLRF LKIWFLYLEG REDFERVYRE IEETEICKGH SLLYEWYAIF 101: LEVKGLWRRA NSVYQTGLSR KAEPFDRLKE AHSLFLQRIS KRTKASSLEK VGDDAQATDL ETGFVNPWET STVNGLIHKI KPQLVKYDGY HVSNKVFPGK 201: ANLSSLQNYS RNKIIEIGGR KYQMKGCAGQ GGFAQVFKAF IDSNPDEVVA LKVQKPPFPW EFHMYRQLDC RIPDSQRSSF GLAQRVHVYS DYSILVCDYL 301: SHGTLQDVIN SYVVVGKSME EVLCMYYTIE MLNMLETLHS VGIIHGDFKP DNLLIRYPPE NLTETGFHEK TGSWSKKGLC LVDWGRGIDL SLFPRTTEFT 401: GDCRTSGFRC VEMKEDKPWK FQVDTYGLCV IVHMMLHNVY MEIEKKQSLD GGYINMPRTS FKRYWKVDLW KELFTKLLNR ETCEDDTETL RNLRKSMEEY 501: ICSDPKLMKK LNELLAKQRI SLCSS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)