AT1G51420.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.767 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : sucrose-phosphatase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
sucrose-phosphatase 1 (SPP1); FUNCTIONS IN: phosphatase activity, magnesium ion binding, sucrose-phosphatase activity, catalytic activity; INVOLVED IN: sucrose biosynthetic process, metabolic process; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: petal, leaf whorl, root, flower, cultured cell; EXPRESSED DURING: 4 anthesis, petal differentiation and expansion stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Sucrose-phosphate synthase (InterPro:IPR006380), Sucrose-6-phosphate phosphohydrolase C-terminal (InterPro:IPR013679), HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB (InterPro:IPR006379), Sucrose phosphatase, plant/cyanobacteria (InterPro:IPR012847), Sucrose-phosphate phosphatase (InterPro:IPR006378); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Sucrose-6F-phosphate phosphohydrolase family protein (TAIR:AT2G35840.3); Has 854 Blast hits to 850 proteins in 328 species: Archae - 0; Bacteria - 616; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 177; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 61 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:19064852..19066704 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 47848.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.04 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.54 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 423 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MERLTSPPRL MIVSDLDETM VDHHKDPENL ALLRFNSLWE DAYRHDSLLV FSTGRAQTMY KKLRKEKPLL TPDVIITSVG TEIAYGNSMV PDDNWVEILN 101: KKWDRGIVQE ETSKFPELTL QGETEQRPHK LSFNIDKSKV KAVTKELSPR LEKRGVDVKF IFSGGNAFDV LAKGGGKGQA LAYLLKKLKT EGKLPINTLA 201: CGDSGNDTEL FTIPNVYGVM VSNAQEELLE WYAENAKDNA NIIHASERCA GGITQAIGHF KLGPNLSPRD VSDFLECKAD NVNPGHEVVK FFLFYERWRR 301: GEVENCTTYT SSLKASCHPS GVFVHPSGAE KSLRDTIDEL GKYYGDKKGK KFRVWTDQVL ATDTTPGTWI VKLDKWEQTG DERKCCTTTV KFTSKEGEGF 401: VWEHVQQIWS EETEIKDDSN WII |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)