AT1G20816.1
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min: :max .
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description (TAIR10) | protein_coding : | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Curator Summary (TAIR10) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Computational Description (TAIR10) |
unknown protein; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: unknown protein (TAIR:AT1G76405.2); Has 52 Blast hits to 52 proteins in 19 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 50; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Coordinates (TAIR10) | chr1:+:7233814..7234941 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Weight (calculated) | 19782.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IEP (calculated) | 9.98 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GRAVY (calculated) | -0.66 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Length | 167 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: METSLRYATN SRSLKIHAKE KFPVNSKTRL QLHGELDTGA GVPSYFCAMI RYFFHEASTN LGVGLHYDKR EKLRCLVRGK KKFPVITDEV VTFNIKGRCD 101: FDQDLVQRNA KGAAEFDWNI WKFQKDQDLR LRIGYEMFEK VPYMQIRENN WTFNTNLKGK WNVRYDL |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
See Also |
|
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)