AT1G20350.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : translocase inner membrane subunit 17-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
mitochondrial inner membrane translocase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
translocase inner membrane subunit 17-1 (TIM17-1); FUNCTIONS IN: protein transporter activity, P-P-bond-hydrolysis-driven protein transmembrane transporter activity; INVOLVED IN: protein transport; LOCATED IN: mitochondrial inner membrane presequence translocase complex; EXPRESSED IN: 11 plant structures; EXPRESSED DURING: 9 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Mitochondrial inner membrane translocase complex, subunit Tim17/22 (InterPro:IPR003397); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: translocase inner membrane subunit 17-2 (TAIR:AT2G37410.2); Has 784 Blast hits to 781 proteins in 207 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 333; Fungi - 216; Plants - 165; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 70 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:7043737..7044393 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 22908.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.51 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 218 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGTPESSREP CPDRILDDVG GAFAMGAVGG SAYHLIRGIY NSPGGARLSG GVQALRMSGP RSGGSFSVWG GLYSTFDCAL VYARQKEDPW NSILSGAATG 101: GFLSLRQGLG ASARSALVGG VLLAMIEGVG IMLNKVQSTA HNEQFMEDHA ATSLPYGMGQ ISGQSVPVPE TSSSSSGSVS WFGSLFKKKK ETEDHHSESR 201: THILESFDAP PVPTYEFK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)