AT1G18570.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : myb domain protein 51 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a member of the R2R3-MYB transcription family. Involved in indole glucosinolate biosynthesis. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
myb domain protein 51 (MYB51); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: SANT, DNA-binding (InterPro:IPR001005), Homeodomain-like (InterPro:IPR009057), Myb, DNA-binding (InterPro:IPR014778), HTH transcriptional regulator, Myb-type, DNA-binding (InterPro:IPR017930), Homeodomain-related (InterPro:IPR012287), Myb transcription factor (InterPro:IPR015495); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: myb domain protein 122 (TAIR:AT1G74080.1); Has 9055 Blast hits to 8387 proteins in 480 species: Archae - 0; Bacteria - 2; Metazoa - 725; Fungi - 509; Plants - 5977; Viruses - 4; Other Eukaryotes - 1838 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:6389765..6391026 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 39156.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.65 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.66 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 352 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVRTPCCKAE LGLKKGAWTP EEDQKLLSYL NRHGEGGWRT LPEKAGLKRC GKSCRLRWAN YLRPDIKRGE FTEDEERSII SLHALHGNKW SAIARGLPGR 101: TDNEIKNYWN THIKKRLIKK GIDPVTHKGI TSGTDKSENL PEKQNVNLTT SDHDLDNDKA KKNNKNFGLS SASFLNKVAN RFGKRINQSV LSEIIGSGGP 201: LASTSHTTNT TTTSVSVDSE SVKSTSSSFA PTSNLLCHGT VATTPVSSNF DVDGNVNLTC SSSTFSDSSV NNPLMYCDNF VGNNNVDDED TIGFSTFLND 301: EDFMMLEESC VENTAFMKEL TRFLHEDEND VVDVTPVYER QDLFDEIDNY FG |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)