AT1G17410.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 0.964 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Nucleoside diphosphate kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Nucleoside diphosphate kinase family protein; FUNCTIONS IN: nucleoside diphosphate kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: in 6 processes; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Nucleoside diphosphate kinase, core (InterPro:IPR001564); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: nucleoside diphosphate kinase 2 (TAIR:AT5G63310.1); Has 9030 Blast hits to 8806 proteins in 2558 species: Archae - 289; Bacteria - 4566; Metazoa - 1151; Fungi - 165; Plants - 382; Viruses - 117; Other Eukaryotes - 2360 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:5968627..5969780 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 19991.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.93 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 181 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSGITYQILF LLLLASVSLS PVRCLGYGAS SEERTLAMIK PDGVSGNYTE EIKTIVVEAG FNIVKEMLTQ LDKETASAFY EEHSSRSFFP HLVTYMTSGP 101: VLVMVLEKRN AVSDWRDLIG PTDAEKAKIS HPHSIRALCG KNSQKNCVHG SDSTSSAERE IKFFFKDVVS GDIATQQHDE L |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)