AT1G11360.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Adenine nucleotide alpha hydrolases-like superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Adenine nucleotide alpha hydrolases-like superfamily protein; INVOLVED IN: response to stress; LOCATED IN: cytosol, plasma membrane; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: UspA (InterPro:IPR006016), Rossmann-like alpha/beta/alpha sandwich fold (InterPro:IPR014729), Universal stress protein A (InterPro:IPR006015); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Adenine nucleotide alpha hydrolases-like superfamily protein (TAIR:AT4G27320.1); Has 1309 Blast hits to 1305 proteins in 243 species: Archae - 8; Bacteria - 416; Metazoa - 122; Fungi - 38; Plants - 720; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 5 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:3822171..3822899 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 26509.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.68 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.61 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 242 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTSPGKSPRS DRKSPTVVTV QPSSPRFPIS TPTAGAQRKI GIAVDLSDES AYAVQWAVQN YLRSGDAVVL LHVQPTSVLY GADWGAMDLS PQWDPNNEES 101: QRKLEDDFDI VTNKKASDVA QPLVEADIPF KIHIVKDHDM KERLCLEVER LGLSTLIMGS RGFGATKRSS KGRLGSVSDY SVHHCACPVV VVRFPDDKDG 201: EDEKSGDSGG ENLMDSDKLH TVPEVAEEEG DKDEYHDASD KQ |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)