AT1G09350.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.981 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : galactinol synthase 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
galactinol synthase 3 (GolS3); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glycosyl transferase, family 8 (InterPro:IPR002495); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: galactinol synthase 2 (TAIR:AT1G56600.1); Has 1260 Blast hits to 1259 proteins in 288 species: Archae - 0; Bacteria - 98; Metazoa - 258; Fungi - 282; Plants - 479; Viruses - 73; Other Eukaryotes - 70 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:3019888..3021214 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 38679.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.40 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 334 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAPEMNNKLS YGEKKRAYVT FLAGTGDYVK GVVGLAKGLR KTKSKYPLVV AVLPDVPADH RRQLLDQGCV IKEIQPVYPP DNQTQFAMAY YVLNYSKLRI 101: WKFVEYSKLI YLDGDIQVFE NIDHLFDLPD GNFYAVKDCF CEKTWSHTPQ YKIGYCQQCP DKVTWPESEL GPKPPLYFNA GMFVYEPSLP TYYNLLETLK 201: VVPPTPFAEQ DFLNMYFKDI YKPIPPVYNL VLAMLWRHPE NIELNEAKVV HYCAAGAKPW RFTGQEGNME REDIKMLVEK WWDIYNDESL DYKNFNVHCG 301: QKEDVHRKPK TLPQFFTDLS EADVLQCAKA PSAA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)