AT1G07135.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 0.989 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : glycine-rich protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
glycine-rich protein; Has 22251 Blast hits to 8348 proteins in 789 species: Archae - 21; Bacteria - 7328; Metazoa - 6126; Fungi - 1280; Plants - 3980; Viruses - 524; Other Eukaryotes - 2992 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:2190157..2190624 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 15682.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 12.03 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.06 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 155 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGLRRTWLVL YILFIFHLQH NLPSVSSRPS SVDTNHETLP FSVSKPDVVV FEGKARELAV VIKKGGGGGG GGRGGGGARS GGRSRGGGGG SSSSRSRDWK 101: RGGGVVPIHT GGGNGSLGGG SAGSHRSSGS MNLRGTMCAV CWLALSVLAG LVLVQ |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)