AT1G04640.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : lipoyltransferase 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Lipoyltransferase, located in mitochondria but not found in chloroplasts | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
lipoyltransferase 2 (LIP2); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Octanoyltransferase (InterPro:IPR000544), Octanoyltransferase, conserved site (InterPro:IPR020605), Biotin/lipoate A/B protein ligase (InterPro:IPR004143); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Biotin/lipoate A/B protein ligase family (TAIR:AT4G31050.1); Has 5700 Blast hits to 5697 proteins in 1675 species: Archae - 17; Bacteria - 3180; Metazoa - 102; Fungi - 137; Plants - 98; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2166 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:1292541..1293248 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 26422.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.02 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 235 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MRSPRTLEVW KLGTVNYLKS LKLQEKLVSE RKAHQIPDTL LSLQHPPTYT LGKRRTDHNL LIPESELTKI GAELHYTQRG GDITFHGPHQ AILYPIISLR 101: SIGFGARNYV ETLERSMIEF ASIYGVKARA GNKCETGVWV GDRKIGAIGV RISSGITSHG LALNIDPDMK YFEHIVPCGI ADKEVTSLRR ETDTLLPSEE 201: VIHEQLVSCL AKAFSYDDVV WKEDPSLILD TQDKE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)