AT1G04010.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 0.750 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : phospholipid sterol acyl transferase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
phospholipid sterol acyl transferase 1 (PSAT1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Lecithin:cholesterol acyltransferase (InterPro:IPR003386); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: phospholipid:diacylglycerol acyltransferase (TAIR:AT5G13640.1); Has 615 Blast hits to 606 proteins in 192 species: Archae - 0; Bacteria - 2; Metazoa - 241; Fungi - 118; Plants - 150; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 104 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:1031703..1036128 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 71691.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.34 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.26 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 633 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGANSKSVTA SFTVIAVFFL ICGGRTAVED ETEFHGDYSK LSGIIIPGFA STQLRAWSIL DCPYTPLDFN PLDLVWLDTT KLLSAVNCWF KCMVLDPYNQ 101: TDHPECKSRP DSGLSAITEL DPGYITGPLS TVWKEWLKWC VEFGIEANAI VAVPYDWRLS PTKLEERDLY FHKLKLTFET ALKLRGGPSI VFAHSMGNNV 201: FRYFLEWLRL EIAPKHYLKW LDQHIHAYFA VGAPLLGSVE AIKSTLSGVT FGLPVSEGTA RLLSNSFASS LWLMPFSKNC KGDNTFWTHF SGGAAKKDKR 301: VYHCDEEEYQ SKYSGWPTNI INIEIPSTSV TETALVNMTS MECGLPTLLS FTARELADGT LFKAIEDYDP DSKRMLHQLK KLYHDDPVFN PLTPWERPPI 401: KNVFCIYGAH LKTEVGYYFA PSGKPYPDNW IITDIIYETE GSLVSRSGTV VDGNAGPITG DETVPYHSLS WCKNWLGPKV NITMAPQPEH DGSDVHVELN 501: VDHEHGSDII ANMTKAPRVK YITFYEDSES IPGKRTAVWE LDKTNHRNIV RSPVLMRELW LQMWHDIQPG AKSKFVTKAK RGPLRDADCY WDYGKACCAW 601: QEYCEYRYSF GDVHLGQSCR LRNTSANMLL QYI |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)