AT3G43270.1
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min: :max .
SUBAcon:extracellular 1.000 ASURE: extracellular What is SUBAcon? |
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Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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Description (TAIR10) | protein_coding : Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor superfamily | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Curator Summary (TAIR10) |
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Computational Description (TAIR10) |
Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor superfamily; FUNCTIONS IN: enzyme inhibitor activity, pectinesterase activity; INVOLVED IN: cell wall modification; LOCATED IN: plant-type cell wall; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 10 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Pectinesterase, active site (InterPro:IPR018040), Pectin lyase fold/virulence factor (InterPro:IPR011050), Pectinesterase, catalytic (InterPro:IPR000070), Pectinesterase inhibitor (InterPro:IPR006501), Pectin lyase fold (InterPro:IPR012334); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: pectin methylesterase 44 (TAIR:AT4G33220.1); Has 2924 Blast hits to 2864 proteins in 331 species: Archae - 6; Bacteria - 617; Metazoa - 1; Fungi - 199; Plants - 2076; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 25 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Annotations |
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Coordinates (TAIR10) | chr3:-:15222402..15225124 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Weight (calculated) | 57638.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IEP (calculated) | 9.08 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GRAVY (calculated) | -0.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Length | 527 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAKFRQMGSS IFFLFLIIIS LCSAHKEAFS STDLVQMECL RVPPLEFAEA AKTVVDAITK AVAIVSKFDK KAGKSRVSNA IVDCVDLLDS AAEELSWIIS 101: ASQSPNGKDN STGDVGSDLR TWISAALSNQ DTCLDGFEGT NGIIKKIVAG GLSKVGTTVR NLLTMVHSPP SKPKPKPIKA QTMTKAHSGF SKFPSWVKPG 201: DRKLLQTDNI TVADAVVAAD GTGNFTTISD AVLAAPDYST KRYVIHVKRG VYVENVEIKK KKWNIMMVGD GIDATVITGN RSFIDGWTTF RSATFAVSGR 301: GFIARDITFQ NTAGPEKHQA VAIRSDTDLG VFYRCAMRGY QDTLYAHSMR QFFRECIITG TVDFIFGDAT AVFQSCQIKA KQGLPNQKNS ITAQGRKDPN 401: EPTGFTIQFS NIAADTDLLL NLNTTATYLG RPWKLYSRTV FMQNYMSDAI NPVGWLEWNG NFALDTLYYG EYMNSGPGAS LDRRVKWPGY HVLNTSAEAN 501: NFTVSQLIQG NLWLPSTGIT FIAGLVS |
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See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)