AT5G17310.2
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : UDP-glucose pyrophosphorylase 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
UDP-glucose pyrophosphorylase 2 (UGP2); FUNCTIONS IN: UTP:glucose-1-phosphate uridylyltransferase activity, nucleotidyltransferase activity; INVOLVED IN: response to cadmium ion, callose deposition in cell wall, response to salt stress, metabolic process, pollen development; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: 27 plant structures; EXPRESSED DURING: 17 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase, subgroup (InterPro:IPR016267), UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase (InterPro:IPR002618); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: UDP-GLUCOSE PYROPHOSPHORYLASE 1 (TAIR:AT3G03250.1); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:5696955..5700845 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 51922.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.79 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 470 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAATATEKLP QLKSAVDGLT EMSENEKSGF INLVSRYLSG EAQHIEWSKI QTPTDEIVVP YDKMANVSED ASETKYLLDK LVVLKLNGGL GTTMGCTGPK 101: SVIEVRDGLT FLDLIVIQIE NLNNKYNCKV PLVLMNSFNT HDDTQKIVEK YTKSNVDIHT FNQSKYPRVV ADEFVPWPSK GKTDKDGWYP PGHGDVFPSL 201: MNSGKLDAFL SQGKEYVFIA NSDNLGAIVD LKILKHLIQN KNEYCMEVTP KTLADVKGGT LISYEGKVQL LEIAQVPDEH VNEFKSIEKF KIFNTNNLWV 301: NLKAIKKLVE ADALKMEIIP NPKEVDGVKV LQLETAAGAA IRFFDNAIGV NVPRSRFLPV KATSDLLLVQ SDLYTLVDGF VTRNKARTNP TNPAIELGPE 401: FKKVASFLSR FKSIPSIVEL DSLKVSGDVW FGSGVVLKGK VTVKANAGTK LEIPDNAVLE NKDINGPEDL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)